Основные цели профильного обучения в лицее № 1:
- углубленное изучение отдельных дисциплин программы полного общего образования;
- создание условий для дифференциации содержания образования лицеистов;
- установление равного доступа к полноценному образованию разным категориям обучающихся в соответствии с их индивидуальными склонностями и потребностями;
- эффективная подготовка выпускников лицея к успешному освоению профессиональных программ высшей школы.

В лицее разработана предпрофильная подготовка учащихся для перехода со второй ступени обучения в старшую профильную ступень. С 5 класса осуществляется мягкая профилизация естественно-научного, физико-математического направлений. С 8 класса предусмотрено предпрофильное и профильное обучение.